UPT SMP Negeri 3 Tuban memiliki laboratorium IPA yang modern dan lengkap untuk mendukung proses pembelajaran berbasis praktik. Laboratorium ini dilengkapi dengan berbagai peralatan eksperimen, mikroskop, serta bahan-bahan kimia yang aman digunakan untuk praktik pembelajaran sains. Dengan fasilitas ini, siswa dapat melakukan eksperimen langsung sehingga lebih memahami konsep-konsep ilmiah secara konkret. Laboratorium ini juga dirancang untuk meningkatkan keterampilan berpikir kritis dan analitis siswa dalam memecahkan masalah sains. Dengan adanya fasilitas laboratorium IPA yang memadai, UPT SMP Negeri 3 Tuban berkomitmen untuk memberikan pengalaman belajar yang lebih interaktif, inovatif, dan menyenangkan bagi seluruh siswa.
